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技术文章
  • 6 2020-4
    肾脏电解质排泄的昼夜调控-旁分泌因子的作用

    1、肾脏生物钟和近日生理学我们早就知道,人体肾脏生理的一些参数在一天24小时内都遵循特定的昼夜节律(如图1所示)。1950年,Sirota等人就招募了18名健康成年人,对肾功能的日变化进行了初步的探索,研究结果表明与白天相比,夜间的排尿量明显减少。此后不久,Mills和Stanbury进行了另一项研究,他们对健康的成年受试者进行12小时的特定训练来代替正常24小时模式,结果发现尿钠和尿钾的日排泄不受以12小时为周期的进食、饮水和睡眠模式的影响017年诺贝尔生理学或医学奖授予了...

  • 6 2020-4
    综述| J HEMATOL ONCOL:肝癌代谢中的circRNAs

    能量代谢的重编程是由基因组不稳定引起的肿瘤的1个标志。在肿瘤进展中广泛存在的代谢紊乱为癌细胞的生长和分裂提供了必要的来源。与正常成人组织相比,肿瘤内的碳水化合物、脂质和氨基酸代谢可能发生显著的转化变化(图1)。*的癌症相关的代谢变化包括:葡萄糖和氨基酸摄取失调、利用营养获取的机会模式、利用糖酵解/三羧酸循环(TCA)、用于生物合成和NADPH生产的循环中间体,以及对氮需求的增加。研究肿瘤异常代谢的机制对制定有效的肿瘤治疗策略具有重要意义。这些能量代谢的重新定向是由蛋白质和非编...

  • 6 2020-4
    NAT MED:绘制肿瘤细胞系代谢图谱

    1从培养的CCLE细胞系中提取代谢产物体外培养20种主要癌症类型的928个癌细胞系,用于124种极性代谢物和101种脂类的代谢组学分析(图1a)。使用层次聚类来评估细胞系之间的代谢相似性。两个主要的聚类与造血系和非造血系有很强的相关性,表明这两组的主要代谢是有差异的(p确切检验)。为了进一步量化代谢物水平(y)与主要癌症谱系(X)的关系程度,采用线性回归模型进行分析。结果表明,225个代谢物中有148个的谱系效应(定义为r2)大于0.1,表明这些代谢物中至少有10%的跨细胞系...

  • 26 2020-3
    不明觉厉!酰基-生物素交换法是个什么 鬼?

    大家在读医学研究文献时常常会看到1种不明觉厉的研究技术,叫“Acyl-biotinylExchange”,12271228翻译过来就是“酰基-生物素交换法”。这种方法主要用于研究蛋白质所发生的翻译后修饰。大多数蛋白分子都有多个不同的翻译后修饰机制,用以调节蛋白功能。蛋白质zui常见的翻译后修饰方式叫磷酸化,主要发生在丝氨酸、苏氨酸等残基位点上,常常通过特异性的抗体进行检测。除了磷酸化之外,蛋白质的翻译后修饰的方式还有很多,例如糖基化、乙酰化、甲基化、亚硝基化、谷胱甘肽化、棕榈...

  • 26 2020-3
    基础扫盲贴:如雷贯耳的 BLAST 到底是 啥?

    Blast(BasicLocalAlignmentSearchTool),可谓生信领域zui常用的工具,拿到1段序列(测序结果,或设计好的引物等等),1般都会去blast1下,查找相似序列。在查找相似序列的基础上衍生出了各种作用,比如鉴别基因组,蛋白质,查找特定靶区,检验引物特异性等等。自打1990年由AltschulSF等人开发出来,NCBI引进,至今还在改善,更新算法。量身选用数据库做BLAST不仅要考虑选择哪种算法,还要考虑选哪个数据库来比对。我们zui常用的可能就人1...

  • 26 2020-3
    来聊一聊那些五花八门的生信数据库

    当我们资源不足时,自然会想要找一些省钱的办法来发文章,穷则思变嘛。生信是个好办法,可是有些医生朋友还是觉得不太熟悉,别说后边的分析方法了,就连开始找数据都不好找。研究肿瘤的比较有福,肿瘤的数据zui丰富了,像大名鼎鼎的TCGA、Ocomine等。可研究其他疾病的怎么办,有没有疾病特异性数据库呢?资源上哪找随着研究成果的积累,大大小小的数据库们就冒了出来,驻扎在互联网的各个角落,现在已1218经有了上千个。找数据比较权wei的资源集中站,是牛津大学出版社的NucleicAcid...

  • 26 2020-3
    肿瘤模型技术要更新了!

    肿瘤细胞构建的大问题在于肿瘤微环境的复杂性,人类的机体并不像培养皿(瓶)般是塑料的。而且随着癌症的复杂性被越来越多的研究揭露出来,肿瘤组织不仅仅是由肿瘤细胞所1214组成的观点已经成为普遍共识,因而,许多研究人员都认为是时候升级他们在实验室中构建肿瘤模型的方法及技术了。肿瘤模型构建的瓶颈肿瘤细胞构建的大问题在于肿瘤微环境的复杂性,人类的机体并不像培养皿(瓶)般是塑料的。而且随着癌症的复杂性被越来越多的研究揭露出来,肿瘤组织不仅仅是由肿瘤细胞所组成的观点已经成为普遍共识,因而,...

  • 26 2020-3
    常见肿瘤动物模型一览

    利用实验动物进行整体水平的肿瘤研究,是基础研究中的重要组成,可以说是高分文章*之选。翠花这里给大家汇总了常用的肿瘤动物模型,欢迎收藏!1、自发瘤模型:实验动物未经任何有意识的人工处理,自然发生肿瘤1208优点:①近似人类肿瘤发生过程,实验结果更易于外推到人;②相比移植瘤,对药物的敏感度不高,疗程长,便于进行综合治疗;③可观察遗传因素在肿瘤发生上的作用。1209缺点:①个体之间生长速度差异较大,肿瘤发生发展参差不齐,很难在限定时间内获得大量生长均匀的荷瘤动物;②试验周期长;③需...

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