当我们资源不足时，自然会想要找一些省钱的办法来发文章，穷则思变嘛。生信是个好办法，

可是有些医生朋友还是觉得不太熟悉，别说后边的分析方法了，就连开始找数据都不好找。

研究肿瘤的比较有福，肿瘤的数据zui丰富了，像大名鼎鼎的 TCGA、Ocomine 等。可研究其

他疾病的怎么办，有没有疾病特异性数据库呢？

资源上哪找

随着研究成果的积累，大大小小的数据库们就冒了出来，驻扎在互联网的各个角落，现在已

1218经有了上千个。

找数据比较权wei的资源集中站，是牛津大学出版社的 Nucleic Acids Research（NAR）杂志。从

1994 年开始，NAR 每年都要出版分子生物学数据库特辑（database issue），收录新增的数据

库、盘点旧数据库的更新状况、移除失效链接等，做个总结。目前版是第 24 版，即 2017 

版。

而所有收录的数据库可以在 NAR 的网站上找到，下面是一个按字母排序的列表

不过找起来更方便的可能是按功能分类查找：

NAR 把数据库分为 15 个类别（有些数据库会同时被分到好几个类别）：

1219有些分类下边还有子类别，可以跟据自己的目的逐级点开，找到相应的资源。比如想找个特

定的疾病，就点开 Human Genes and Diseases，下边还有 4 个子分类，其中癌症基因数据库

是单*个子类（Cancer gene databases），其他的疾病可以点开 Gene-, system- or disease

specific databases，就可看到具体数据库列表。

1220这当然只是一部分啦~

图中可看到注意力缺陷多动障碍（ADHDgene），自身免疫性淋巴细胞增生综合征（ALPSbase），

阿兹海默病（AlzGene）等等。

点进去会有数据库的描述说明，或详或略。并附有数据库网站链接，点进去就是了。

注意数据库的质量

数据库这么多，也有大小之分，当然不是随便一个数据库拿来就用，用了就能得到非常牢靠

的研究成果。

一个成功的数据库背后，要有良好的管理维护工作。大数据库为什么著名、好用，是因为有

一个大集团在运营。比较著名的机构有美国国家生物技术信息中心（NCBI）、欧洲分子生物

学实验室-欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）、瑞士生物信息学研究所（SIB）、日本国立遗

传学研究所（NIG）、华大基因（BGI）等。

而一些小团队为自己特定的研究领域创建的数据库，质量就参差不齐了，上边提到的疾病特

异性数据库大多属于此类。

1221虽然小团队不容易跟大佬竞争，而且有时候同一个领域会有好几个相似的数据库，NAR 也不

介意都收录，只要它们符合一定质量条件，且还在运营、维护、为研究者提供服。因为 NAR

鼓励良性竞争，让那些数据库经历时间的考验证明自己。像研究 G 蛋白耦联受体的 GPCRdb

和研究碳水化合物活性酶的 CAZy 就是小团队的成功范例。

对于用户来说，采用一个数据库做研究之前要多留心，要了解好它的数据来源和运营维护情

况，是否有及时回应用户的反馈，是否有版本控制；还要多检索文献，看看这个数据库的使

用情况，大家利用它做出了哪些成果，反馈如何等等。必要时可多找几个相关的数据库互相

佐证。