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降落PCR
(如有不明,可以咨询超博小凌)
降落 PCR(touchdown PCR),一种 PCR 技术,主要用于 PCR 的条件的优化。在许多情
况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效
率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。
实验材料:
基因样品
仪器、耗材:
PCR仪
实验步骤:
1. 反应体积为50 μl。
2. 人CD137胞膜外区基因的PCR扩增体系:CD137-pCDNA3质粒4 μl,P1,P2各0.5
μmol/L,MgCl2 2 mmol/L,dNTP 0.4 mmol/L,Taq 5 U。
3. hIgG1Fc片段的PCR扩增体系:含人hIgG1Fc的PGEM-T质粒4 μl,P3、P4 各0.4
μmol/L,MgCl2 2 mmol/L,dNTP 0.4 mmol/L,Taq 5 U。
4. HBVDNA多聚酶基因的PCR扩增体系:
(1)Di一轮:HBVDNA模板4 μl,P5、P6各0.25 μmol/L,MgCl2 1.5 mmol/L,dNTP
0.2 mmol/L,Taq 0.8 U.
(2)第二轮:取5倍稀释的Di一轮PCR产物4μl为模板,P7、P8各0.25 μmol/L,MgCl2 1.5
mmol/L,dNTP 0.2 mmol/L,Taq 0.8 U。
5. 分别在各灭菌PCR管加入上述各反应成分,100℃煮沸5 min,立即冰浴5 min,加入
TaqDNA聚合酶,混匀,离心,PCR程序如下:
6. 取 10 μl PCR 扩增产物,在2%或3%琼脂糖凝胶上电泳,紫外灯下观察扩增产物。
注意事项:
由于目标是在较早的循环中避免低Tm 值配对,在TD—PCR中应用热启动技术。设计
时,退火温度的范围应跨越15℃左右,从高于估计Tm 值至少几度到低于它10℃
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